Do nemocnice se dostanete nejlépe MHD, a to metrem C nebo B do stanice „Florenc“, poté autobusem č. 207 směr Staroměstská a vystoupíte na zastávce „Nemocnice Na Františku“ (4. stanice od metra Florenc), anebo ze stanice metra A „Staroměstská“ autobusem č. 207 do zastávky „Nemocnice Na Františku“. Jinou možností je přijet tramvají č. 17 do zastávky „Právnická fakulta“ a dojít pěšky cca 250 m ulicí Na Františku podél Vltavy.

Pokud se rozhodnete přijet autem, můžete zaparkovat před areálem nemocnice v ulici Dušní na vyznačených místech zdarma. Místa jsou určeny ke krátkodobému parkování po dobu nezbytně nutnou k absolvování ambulantního vyšetření či ošetření, nebo k návštěvě lékárny. Parkovací kartu obdržíte ve vrátnici za vjezdovou bránou v ulici Dušní. Počet parkovacích míst je omezen.

Další možností je využít krátkodobého placeného parkování prostřednictvím parkovacích automatů nebo aplikace MPLA na vyznačených místech v okolí nemocnice. Nejbližší místa placeného stání jsou v Dušní ulici u hotelu President.